| GI |
1101875  |
| Accession |
U19957 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Ceratobasidiaceae ; Thanatephorus ; Thanatephorus cucumeris
|
| Sequence |
ATGAAATCTTCAAAGTCAAACCTTTTGTTAACTCAATTGGTTCTGCTTTGGTATTGGAGGTCTATTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTAGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCTGTTAAAAAGGGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACTGCTTCTAACAGTCCATTGACTTGGACAAATATTAATTTTATGATCTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-12.8 kcal/mol |
| Model |
117938168 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATCTTCAAAGT-AAATCTTTTGTTAACTCAATTGGTNCTACTTTGGTATTGGAGGTCT-TTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTCGTT-CATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACA--CTGTAACAC----GTGGCCAAGGGAAATGCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGAC----ACTATTTTTATGATCTGA
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Query: ATGAAATCTTCAAAGTCAAACCTTTTGTTAACTCAATTGGTTCTGCTTTGGTATTGGAGGTCTATTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTAGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCTGTTAAAAAGGGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACTGCTTCTAACAGTCCATTGACTTGGACAAATATTAATTTTATGATCTGA
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CBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _______________(____(__________________)____)_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 100
III: 85.714
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 363
End: 612
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