GI |
1101879  |
Accession |
U19961 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Ceratobasidiaceae ; Thanatephorus ; Thanatephorus cucumeris
|
Sequence |
ATGAAATCTTCAAAGTCAAACCTTTTGTTAACTCAATTGGTTCTGCTTTGGTATTGGAGGTCTATTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCTGTTAAAAAGGGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACTGCTTCTAACAGTCCATTGACTTGGACAAATATTAATTTTATGATCT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-14.1 kcal/mol |
Model |
117938168 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATCTTCAAAGT-AAATCTTTTGTTAACTCAATTGGTNCTACTTTGGTATTGGAGGTCT-TTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTCGTTCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACA--CTGTAACAC----GTGGCCAAGGGAAATGCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGAC----ACTATTTTTATGATCTGA .........(((((((-(.(((..(((......)))..)))..))))))))....(((((...-..((((........)))).)))))..(((((((.((....((((.((((((((....(((...(((((((.((((...))))...)))))))))).--.))))))))----........))))...)).)))))))...........(((((......)))))----.................. Query: ATGAAATCTTCAAAGTCAAACCTTTTGTTAACTCAATTGGTTCTGCTTTGGTATTGGAGGTCTATTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCTGTTAAAAAGGGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACTGCTTCTAACAGTCCATTGACTTGGACAAATATTAATTTTATGATCT-- .........(((((((.(.(((..(((......)))..)))..))))))))....(((((......((((........)))).)))))..((.((((.((....(.((..(.(.(((....(((...(((((((.((((...))))...))))))))))....))).).).............)).)...)).)))).))...........(((((......)))))....................-- CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________(____(__________________)____)____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 85.714 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 368
End: 614 |