GI |
1101880  |
Accession |
U19962 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Ceratobasidiaceae ; Thanatephorus ; Thanatephorus cucumeris
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Sequence |
ATGAAATTCTCAAAGCAAACCTTTTGTTAATTCAACTGGCCTTGCTTTGGACTTGGAGGTCTTGCAGATGTCACAGTCTGCTCCTCTTAAATATATTAGCTGGATCTCAGTATACACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTATCACTCGCTGAGGACACTGTAAAAGGTGGCCAGGCAATCAGATGACCGCTTCTAATAGTCCATTCACTTGGACAATTACATTTATGATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-33.9 kcal/mol |
Model |
83272313 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATCCTCAAAATAAATCTTTTGTTAATTCAACTGG-TTTACTTTGGACTTGGAGGTCTTTGCAGATTTCAC-GTCTGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATCT--GTATGAACTCGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTATCACTCGCTGAGGACACTGTAAAAGG-GGCCGGGATTATTATGAACCGCTTCTTAATAGTCCATTGACTTGGACAAAC-TACTTATGATAT-- .........(((((.((((((....(((.....))).))-)))).)))))....(((((.....((((((.....-)))))).)))))..........(((.((.((.--..((((.(((((((((.(((((((.(((....)))...)))))))............))-))))))).))))...)).)))))........(((((......)))))....-............-- Query: ATGAAATTCTCAAAGCAAACCTTTTGTTAATTCAACTGGCCTTGCTTTGGACTTGGAGGTC-TTGCAGATGTCACAGTCTGCTCCTCTTAAATATATTAGCTGGATCTCAGTATACACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTATCACTCGCTGAGGACACTGTAAAAGGTGGCCAGGCAATCAGATGACCGCTTC-TAATAGTCCATTCACTTGGACAATTACATTTATGATCTGA .........(((((.(((.((....(((.....))).))..))).)))))....(((((..-..((((((......)))))).)))))..........(((.((.(...........(((((((((.(((((((.(((....)))...)))))))............)).))))))).........).)))))..-.....(((((......)))))................... CBCs: _______________(___________________________)___________________________________________________________________________(______________________________________________________)_____________________________________________________________ HCBCs: ___________________(__________________)__________________________________________________________________(________________________________________________________________________________)_________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 92.857 II: 100 III: 83.333 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 326
End: 559 |