| GI |
18481502  |
| Accession |
AF461566 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
| Sequence |
GTGAAATTCTCAAGCTAGATGCTTTTTTGTAAATAAAAAGGTTGTCTTAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCGTTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGACCCTTGTGATGACATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAGTTCTCGTTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGCTTATGGGTTGCTAATCGCAATCTATTCCATTTTCAATTTTGA |
| Structure |
.........((((((((((((((((((((....))))))))).)))).))))))).....(((((..((((((.....))......)))).)))))....((.(..(((.(((((..(((..(((.(.(.((((((((((((.(((....))....))))))))....).....)).).).).)).))).))..)))))))).))).....(.((...)).).................................. |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-18 kcal/mol |
| Model |
82796523 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAATCTCTCAAATCAGATGCTTTATT------------GTTGTCTTGATTTGGAT-TTGGACTCTGCTGCGTCAAATG------CAGCTGGTCTTAAAAGCATTAGCTGGTCCTCATGTAGGT-TTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTATCT-ACCGCTGAGGACATTCTTCGGAGTGGCCAGGCTCACTTAGGACTGCT-TCTAAT-AGTCCTTTGGACAATTTATCTTAATCTGA-----------------
.........(((((((((((((......------------)).)))).)))))))..-..(((((..(((((((...)))------)))).)))))....((.(..(((.((((((.(((..(((-(.(.((((((((((((.(((....))..-.))))))))....).....)).).).).)).)))).).)))))))))-)))...-.((((...)))).................-----------------
Query: GTGAAATTCTCAAGCTAGATGCTTTTTTGTAAATAAAAAGGTTGTCTTAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCGTTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGACCCTTGTGATGACATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAGTTCTCGTTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGCTTATGGGTTGCTAATCGCAATCTATTCCATTTTCAATTTTGA
.........(((((((((((((..................)).)))).))))))).....(((((..((((((.....))......)))).)))))....((.(..(((.(((((..(.(..(((.(.(.((((((((((((.(((....))....))))))))....).....)).).).).)).)))..)..)))))))).))).....(.((...)).)..................................
CBCs: _____________(((________________________________)))___________(______(_________________)_____)_________________((__________(______________________________________________________________)_________))__________________________________________________________
HCBCs: _______________________________________________________________________((_____))_____________________________________(_(__(_(______(_____________________________________________)______)__))__)___________________(__(___)__)__________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 91.667
III: 94.286
IV: 75
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 409
End: 664
|
