GI |
18481518  |
Accession |
AF461582 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
Sequence |
ATCACTATCCCCTCGAGCCTTTGGCTTGGTCGTTGGGTCATTGTCCCTCCCATGCTCTAAGGGGGAGGGACAGGCCCNAAAGGTAGTGGTAGCTCTGGGAACGGTCCACGGGCGGTGGTGCAGACGAGGGGAGTCTCTCTTCTACCGCCCCCGTGGGTTGTGCCTAATGGCTTTGCCCGAGAGTGTCGGTTTCGGGGAGGAGTCCGCTCCCCCCCTTCAGGTT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-26.7 kcal/mol |
Model |
311334369 |
Alignment |
Sbjct: ATTGCCATCCCCTCAAGCTCT--GCTTGGCTTGTTGGGCCGGCGTCCGCCCGGGGCTTCGCCTCGGGGGGATGGGCCCGAAAGGCAGTGGCGGCTCCCGGAGGGTGGTCCTTTGGGTGGTGATAC-----ATGGGTGTCT-TCTTCCACCG-CTCTGCTGGCCACGCTCCGGGGGCCTGTCGAACGAACGGTCTTCCCCTTTAGGTTGA---------------------- .............(((((...--)))))((((.(((((((..(((((.((((((((...)))))))).)))))))))))).))))..(((((((((((((.((((((.((..((((((((((.(.-----(.((....))-).)).)))))-.))))..)))))).))))))))).))))))...............((....))....---------------------- Query: ATCACTATCCCCTCGAGCCTTTGGCTTGG-TCGTTGGGTCATTGTCCCTCCCATGCTCTAAGGGGGAGGGACAGGCCCNAAAGGTAGTGGTAGCTCTGGGA--ACGGTCC-ACGGGCGGTGGTGCAGACGAGGGGAGTCTCTCTTCTACCGCCCCCGTGGGTTGTGCCTAATGGCTTTGCC---CGAG-AGTGTCGGTTTCGGGGAGGAGTCCGCTCCCCCCCTTCAGGTT .............(((((.....)))))(-(..(.(((((..(((((.((((.(.......).)))).)))))))))).)..).)...(((((.((...(.--((((.((-.((((((((((.(......(.((....)).).)).)))))..))))..))))))...)...))..)))))---....-........((....)).......................... CBCs: __________________________________________(_____(__(_(_______)_)__)_____)______________________________((__________________________________________________________))__________________________________________________________________ HCBCs: ______________(___________)_(_________(____(___________________________)__)_________)____((((______(_____((_____((_((___((_(___________________))_)___)__)_))____))_____)_______))))_________________((____))__________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 75 III: 80 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 420
End: 642 |