| GI |
189306994  |
| Accession |
EU597083 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina cf. cinerea UBCOGTR0443s
|
| Sequence |
GTGAAATTTCTCAAAGCTTGGATGGCCTTTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTGTATTGGGGACGGCTGGGCCTTAAAAACATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACGTCTTTTGGGATGGCCAGTGCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGGTTCCACTTTTCAGCTTTGA |
| Structure |
(((((..(((((.(((.((((((((.....(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((((..((((.(((.((((((.((..((...)))..)))))).)))).))))))))).(((...((((((.((((...(.(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))).)..))).............. |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-6.9 kcal/mol |
| Model |
215433632 |
| Alignment |
Sbjct: GCGAAATTTCTC-AAGCTTGGATGG--ATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATT-GGTACGGCT-GGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGT-GTTCCAC-ATTCAGC-TTGACCTCGA
(((((..(((((-(((.((((((((--(..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.-((.((((((-(((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....))))))-)..))).-.......-..........
Query: GTGAAATTTCTCAAAGCTTGGATGGCCTTTTTTTGTCTGT-CCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTGTATTGGGGACGGCTGGGCCTTAAAAACATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACGTCTTTTGGGATGGCCAGTGCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGGTTCCACTTTTCAGCTTTGA------
(((((..(((((.(((.((((((((.....(...).))))-.).))).))))).....))).))))).(((((...(((..((.((((((.((...(...).)..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))).)..)))..............------
CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _(_____________________(_____________)___________________________)__________(______________(_____________)_____________)_____________________________(__________________________________)______________________________((________________)_)_________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 95.652
II: 95
III: 96.296
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 423
End: 676
|
