GI |
204306505  |
Accession |
FJ152521 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
Sequence |
GTGAAATTTCTCAAAGCTTGGATGGCCTTTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTGTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAACATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACGTCTTTTGGGATGGCCAGCGCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGGTTCCACTTTTCAGCTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-10.9 kcal/mol |
Model |
215433632 |
Alignment |
Sbjct: GCGAAATTTCTC-AAGCTTGGATGG--ATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAA-CTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGT-GTTCCAC-ATTCAGC-TTGACCTCGA (((((..(((((-(((.((((((((--(..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))......-..(((...((((((.(.....))))))-)..))).-.......-.......... Query: GTGAAATTTCTCAAAGCTTGGATGGCCTTTTTTTGTCTGT-CCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTGTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAACATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACGTCTTTTGGGATGGCCAGCGCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGGTTCCACTTTTCAGCTTTGA------ (((((..(((((.(((.((((((((.....(...).))))-.).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.((((((((...(...).)..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).))).........(((...((((((.(.....)))))).)..)))..............------ CBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _(_____________________(_____________)___________________________)__________(____________(_____________)_____________)________________________________________________________________________________________________((________________)_)_________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.652 II: 95 III: 96.296 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 390
End: 642 |