| GI |
244538350  |
| Accession |
FM999678 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
| Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTGTCTATCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCTTTATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCNGACCCTTGTGTAGCACCGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGAGGTGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACATGNNTTCGCAGATTGTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-10.9 kcal/mol |
| Model |
215433632 |
| Alignment |
Sbjct: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGTGTTCCAC-ATTCAGC-TTGACCTCGA
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Query: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGG-CTTTTTGTCTAT-CCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGT-CTTTATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCNGACCCTTGTGTAGCACCGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGAGGTGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACATGNNTTCGCAGATTGTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA------
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CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _____________________((___________))_____________________________________(____________(_____________)_____________)_____________________________(_________(______________)_________)_______________________________(________________)__________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 95.652
II: 85
III: 100
IV: 90
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 370
End: 615
|
