| GI |
291337427  |
| Accession |
GQ219882 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
| Sequence |
GTGAAATTGTCAAGCTTTGATGCTTTTTCCTGTCAAAAAGGCCCTCTCAGCTTGGTTGTTGGGCTCTGCCGTGCTCTTTATTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGTATTAGCTTGATCCTCTTGGGTAAATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATGATCTCTGTGACCGCTGAGGACATCTTCCGAGATGGCCAATTCTCGATTGGGTTGCTTCTAATCTGGCTCTACGGATTTACGAATCCGTGCCGCTTCTGATTTTTTGG |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-2.3 kcal/mol |
| Model |
18481501 |
| Alignment |
Sbjct: GTGAAATTCTCAAGC-TAGATGCTTTTTTGTAAATAAAAAGGTTGTCTTAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCGTTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAG-TTGACCCTTGTGATGACATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATC----TGACCGCCGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAGTTCTCGTTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGCT-TATGGGTTGCTAATCGCAATCTATTCCATTTTCAATTTTGA--
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Query: GTGAAATTGTCAAGCTTTGATGCTTTTTCCT-GTCAAAAAGGCCCTCTCAGCTTGGTTGTTGGGCTCTGCCGTGCTCTTTATTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGTATTAGCTTGATCCTCTTGGGTAAATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATGATCTCTGTGACCGCTGAGGACATCTTCCGAGATGGCCAATTCTCGATTGGGTTGCT-TCTAATCTGGCTCTACGGATT-----TACGAATCCGTGCCGCTTCTGATTTTTTGG
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CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _____________________(_____________________)______________________________((_______))_____________________________(_______(_____(_____________________________________________________________)________)_)_______________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 80
II: 92.308
III: 89.655
IV: 100
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 416
End: 673
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