| GI |
291337483  |
| Accession |
GQ219938 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
| Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTTTGGATGGCTTCTTTTGTCTGTCCCTTAGCATTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGATGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCATGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGATCGCTGAGGACATCTTTTCGGGATGGCCGGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAACCTGGTTTTGCAGATGCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTTTCAGCTTTGA |
| Structure |
(((((..(((((((...(((((((((....(...).))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.((((((((((....))))).)).))).))))).)))))))))).))).......(((...((((((((...)).))))))..)))................ |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-9.7 kcal/mol |
| Model |
215433632 |
| Alignment |
Sbjct: GCGAAATTTCTCAAGC--TTGGATGGATT-TTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTT-GGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGTGTTCCACATTCAGCTTGACCTCGA
(((((..((((((((.--(((((((((..-(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....))))-.)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))..................
Query: GTGAAATTTCTCAAGCTTTTGGATGGCTTCTTTTGTCTGTCCCTTAGCATTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGATGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCATGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGATCGCTGAGGACATCTTTTCGGGATGGCCGGTTCTCATTTGGGTTGCTTCT-AACCTGGTTTTGCAGATGCTTCAATCTGTGTTCCACTTTT--TTCAGCTTTGA
(((((..(((((((....((((((((....(...).))))..).)))..)))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....))))..)).))).))))).)))))))))).)))...-....(((...((((((........))))))..))).....--...........
CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________________________(___________________________________)_________________________________________________________________________
HCBCs: _(______________________(____________)___________________________)____________(_____(____(_____________)____)______)__________________________________(______________________________)________________________________((________________))_______________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 91.304
II: 100
III: 100
IV: 90
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 460
End: 713
|
