| GI |
306030542  |
| Accession |
HM164626 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
| Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCCGCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGCCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA |
| Structure |
(((((..((((((((.((((.(((...(...).)))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..))).............. |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-24.8 kcal/mol |
| Model |
215433632 |
| Alignment |
Sbjct: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGTGTTCCAC-ATTCAGC-TTGACCTCGA
(((((..((((((((.(((((((((..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..))).-.......-..........
Query: GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCCG-CCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGCCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA------
(((((..((((((((.((((.(((...(...).)))-..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))..............------
CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _(____________________________________________________________)_____(_________________(_____________)________________)__________________________(__________________________________)______________________________((________________))_________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 91.304
II: 100
III: 96.296
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 410
End: 657
|
