GI |
310751971  |
Accession |
HQ271352 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTGTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCCAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-19.6 kcal/mol |
Model |
215433632 |
Alignment |
Sbjct: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGTGTTCCAC-ATTCAGC-TTGACCTCGA (((((..((((((((.(((((((((..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..))).-.......-.......... Query: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCTGT-CCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTGTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCCAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA------ (((((..((((((((.((((((((...(...).))))-.).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))..............------ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________(___________)______________________________________((___________(_____________)____________))_____________________________(__________________________________)______________________________((________________))_________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.652 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 378
End: 625 |