GI |
323320654  |
Accession |
JF273551 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina sp. EMF53
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Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTCTGTCCTTAGTTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCTCTTCATTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACATTCTGATCGTTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCGGTCTTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTTACAGTTTGTTTCAATCTGTATTCCACTTTTCAACTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-9.8 kcal/mol |
Model |
215433632 |
Alignment |
Sbjct: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTC-CTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGG-TTTCACAGATTG-TRCAATCTGTGTTCCACATTC--AGCTTGACCTCGA (((((..((((((((.(((((((((..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((-...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((-...((((((.(.-....)))))))..))).....--............. Query: GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTT--TCTGT-CCTTAG-TTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCTCTTCATTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACATTCTGATCGTTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCGGTCTTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTTACAGTTTGTTTCAATCTGTATTCCACTTTTCAACTTTGA------ (((((..((((((((.(((((((((.....--)))))-.).)))-))))).....))).))))).(((((....(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((.......(((.(((((.((((....)))).)).))).)))...)))))))))).)))........(((....(((((..(......).)))))..)))..............------ CBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(___________________)_________________________ HCBCs: _(____________(_______(___________)__________)________________)________________________(_____________)______________________________________________(_____(________________)______)_______________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.652 II: 100 III: 92.593 IV: 90 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

environmental samples

uncultured fungus

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 379
End: 626 |