GI |
63408736  |
Accession |
AY969890 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; environmental samples ; uncultured Basidiomycota
|
Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGCGGCAGTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTGTTCAATCTGTGGCTCCACTTTTCAGCTTT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-13.7 kcal/mol |
Model |
215433632 |
Alignment |
Sbjct: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGT-GTTCCAC-ATTCAGCTTGACCTCGA (((((..((((((((.(((((((((..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....))))))-)..))).-................. Query: GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTGTCTGT-CCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGCGGCAGTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTGTTCAATCTGTGGCTCCACTTTTCAGCTTT------- (((((..((((((((.((((((((...(...).))))-.).))).))))).....))).)))))..((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))..(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))).)..)))............------- CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _(____________________(___________)___________________________)__________(____________(_____________)_____________)_____________________________(__________________________________)______________________________((________________)_)________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.652 II: 95 III: 96.296 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 369
End: 615 |