| GI |
78191197  |
| Accession |
DQ233818 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured ectomycorrhizal fungus
|
| Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGCCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTT |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-27.3 kcal/mol |
| Model |
215433632 |
| Alignment |
Sbjct: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGTGTTCCAC-ATTCAGCTTGACCTCGA
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CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _(____________________________________________________________)_____(_________________(_____________)________________)__________________________(__________________________________)______________________________((________________))________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 95.652
II: 100
III: 96.296
IV: 100
|
| Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 390
End: 635
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