GI |
99030429  |
Accession |
DQ492694 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Multiclavula ; Multiclavula ichthyiformis
|
Sequence |
ATGAAGCTCTCAAGCTGATTACTTTATTGTAAATCGCAGGCTTGGATTTGGACTTTGGAGTTTTCTCATCAGATAGCCCCTGGTCTTAAATACATTAGCTGACCCTCGTTTGTGGAATCGGTTCTACTCGACGTGATAAGTATCAATCGTTGAGGACATTCTTAGGGATGGCCGGGATCACCTAGGGACGCTTACAATTGTGTCTTGGACACACTTTTTTCAATT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-13.8 kcal/mol |
Model |
224459523 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAGCTCTCAAGCAGAATCCTTTATTGTGATTCTT--GTTTGGATTTGAACTCTGCCGTGTT--------AAAGCGGCTGGTTCTAAAAGCATTAGCTGGTCCTTGATTTT---CTTGGTTCTACTCGGCGTGATAATTATCTAACGTTGAGGACATCTCTTTATTGAGGTGGCCAGGGTTTTCTATGGGTTGCTTCTAATCGTCTTCACAGACA-ATATATTTCAATATCTGA .........(((((((((((((......).))))).)--))))))....(((((..(((((.(.--------..)))))).)))))....((.(..(((.((((((.((....---(((((((((((((((((((((....))).).)))))))....)......)..)....)))).)))...)).).)))))))))))....(((.(...)))).-.................. Query: ATGAAGCTCTCAAGCTGATTACTTTATTGTAAATCGCAGGCTTGGATTTGGACTTTGGAGTTTTCTCATCAGATAGCCCCTGGTCTTAAATACATTAGCTGACCCTCGTTTGTGGAATCGGTTCTACTCGACGTGATAAGTATCAATCGTTGAGGACA----TTCTTAGGGATGGCCGGGATCACCTA-GGGACGCTTACAATTGT-GTCTTGGACACACTTTTTTCAATT----- .........((((((.((((.(......)..))))....))))))....(((((..((.((.(...........))).)).))))).......(..(((.(.((((.(.........(((((((..(((((((((((....))).).)))))))....----......)....)))).)).....).)-))).)))))......((-.(...).))...............----- CBCs: __________________(_____________)_________________(______(____________________)_____)_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________(__________________________)________(___________________________________)______________(_(_______________(___________(__________________)____________________________)____________)_)______________(___)_______________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 84.615 II: 90.909 III: 80 IV: 75 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 358
End: 582 |