| GI |
157057268  |
| Accession |
EU118616 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina cinerea
|
| Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGCCCTTCATTGGGGACGGCTGGCCTTATAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA |
| Structure |
(((((..((((((((.((((((((...(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.(((.(((((((((..(....)))..)))))).)))).))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..))).............. |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-31.3 kcal/mol |
| Model |
215433632 |
| Alignment |
Sbjct: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATT-GGTACGGCTGGCCTTA-AAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGTGTTCCAC-ATTCAGC-TTGACCTCGA
(((((..((((((((.(((((((((..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.-((.(((((((((..(.-..)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..))).-.......-..........
Query: GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCCGT-CCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGCCCTTCATTGGGGACGGCTGGCCTTATAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA------
(((((..((((((((.((((((((...(...).))))-.).))).))))).....))).))))).(((((...(((..((.(((((((((..(....)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))..............------
CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _(____________________________________________________________)_____(__________________(______________)________________)__________________________(__________________________________)______________________________((________________))_________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 95.652
II: 100
III: 96.296
IV: 100
|
| Model for |
root
| cellular organisms
Eukaryota
Fungi/Metazoa group
Fungi
environmental samples
uncultured ectomycorrhizal fungus
|
| Dikarya
Basidiomycota
Agaricomycotina
Agaricomycetes
Agaricomycetes incertae sedis
Cantharellales
Clavulinaceae
Clavulina
Clavulina rugosa
| Clavulina cf. amethystina Hy26
|
| environmental samples
uncultured Clavulina
| uncultured Clavulinaceae
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 436
End: 685
|
