GI |
157086829  |
Accession |
EF634121 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
Sequence |
ACGAAATTTGTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTTGTCTGTCCATTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTATCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGCGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATACATCTGATCGCTGAGGACATCTTTCAGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGCGTTCCACTTTTCAGCTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-11.5 kcal/mol |
Model |
199594073 |
Alignment |
Sbjct: ACGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCC---TTTGTCTATCC-TTAG-CTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGCCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGTACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATA-GTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCAC-TTTCAGCTTTGA .((((..((((((((((.((((((.(---...).))))).-).))-))))).....))).))))..(((((...(((.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....(-(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).))).........((...((((((.(.....)))))))..))..-............ Query: ACGAAATTTGTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTTGTCTGTCCATTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTATCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGCGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATACATCTGATCGCTGAGGACATCTTTCAGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGCGTTCCACTTTTCAGCTTTGA .((((..((.(((((((.((((((.(......).)))))..).)).)))))......)).))))..((.((...(.(.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..).).)).)).(((...((((((.((((......(.(((.(((((..(((....)))..)).))).))))..)))))))))).))).........((...((((((.(.....)))))))..))............... CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________(______________)________________________________(____(________________________________________)__)___________________________(__________________________________)_______________________________(________________)____________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.238 II: 90 III: 92.593 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 409
End: 659 |