GI |
148612667  |
Accession |
EF417799 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
Sequence |
GTGAAATTCTCAAACCGGGATGCTTTTTTGTTTCTCGGCTTGGTGTTGGGCTTTTGCAGTTCCTTTGATTGGGATGGCTGGCCTCAAAAGCATTAGCTGGCTTTTCATGTGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATGATCTGACCGCCGAGGACATCTTTCGAGATGGCCAATTCTCATTTGGGCTGCTCCTAATTTTGGTCGAACGGATTCTGAATCTGTTCCACTTTTCAGCTTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-0.9 kcal/mol |
Model |
197112392 |
Alignment |
Sbjct: GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTGTCTGCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGA-TCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACAGCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTATAGGCCTGGTCTTGCAGATTGTTCAATCTGTGGGCTCCACTTTTCAGCTTTGA- (((((..((((((((.((((.(((...(...).)))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).-)))..))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....))))))..)..)))..............- Query: GTGAAA-TTCTCAAACCGGGAT-GCTTTTTTGTTT----CTCGGCTTGGTGTTGGGCTTTTGCAGTTCCTTTGATTGGGATGGCTGGCCTCAAAAGCATTAGCTGGCTTTTCATGTGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATGATCTGACCGCCGAGGACATCTTTCGAGATGGCCAATTCTCATTTGGGCTGCTCCTAATTTTGGTCGAACGGATT-CTGAATCTGT----TCCACTTTTCAGCTTTTGA (((((.-.((((((..(((...-(...(...).).----.)))..)))).....))..))))).((.((....((.((.(((((((((.......))..))))))..)))..))..)).)).(((....(((((.((((.....(..((.((((...(((....)))...).))).)).)..)))))))))..)))........(((....(((((.(-....))))))----.)))............... CBCs: _________________(_______________________)__________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ________________(______(_________)________)_____________________(__(______(_((__(_______________________)___))__)____)__)_______________________(_____(_______________________)____)_______________________________(_(____________)_)_______________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 76.19 II: 85 III: 84.615 IV: 90 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 348
End: 588 |