GI |
299789766  |
Accession |
GU598051 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Pucciniomycotina ; Pucciniomycetes ; Pucciniales ; Pucciniaceae ; Puccinia ; Puccinia graminis
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Sequence |
ATGAAACCCTCTCATTAAACATTTTATTTTTGATTTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTACCTATAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGTAAAACACTTGCCATCTTGTTTGTTAATAAGAGACTCCTAAAACCCAATATCTTATTTTTAAGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-4.01 kcal/mol |
Model |
300295303 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAACCCTCTCATTAAACATTTTTTAACYTGTTTAAAATTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGT--CATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGC--AATACTTGCCATCTTGTTTAAT-ATGAGGGACTTCTAAAAACCCCCCTTTTTTTAAAATTTAAGA .....(.(.((.(((((((((....((...((....)))).))))))))))).).)(((((..((((.--...)))).)))))....(.((.(((((.(((((.(((((((.(((.......((((((..(.(((((..(.(.......).)))))).).--.))))).)))).))))))))..-..))))))))).))).............(((((...)).))) Query: ATGAAACCCTCTCATTAAACATTTTAT------TTTTGATTTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTACCTATAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGTAAAACACTTGCCATCTTGTTTGTTAATAAGAGACTCCTAAAA----CCCAATATCTTATTTTTAAGA .....(.(.((.(((((((((....((------.....)).))))))))))).).)(((((..((((......)))).)))))....(.((..((((..((((.(((((((.(((.......((((((..(.(((((..(.(.......).)))))).)....))))).)))).)))))))).....))).))))..)))..----.......(((.(...)..))) CBCs: _________________________(_____________)___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________________________________________________________________________________________((_______________________(_____________________________________)________________)_____)__________________________(__________)_ |
Transferred percentage of helices |
I: 88.235 II: 100 III: 94.595 IV: 80 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

Dikarya

Basidiomycota

Pucciniomycotina

Pucciniomycetes

Pucciniales

Pucciniaceae

Puccinia

Puccinia graminis

Puccinia graminis f. sp. avenae

| Puccinia graminis f. sp. dactylis

| Puccinia graminis f. sp. poae

| Puccinia graminis f. sp. lolii

|
| Puccinia dichondrae

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 424
End: 640 |