GI |
52547258  |
Accession |
AY722782 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Siderastreidae ; Psammocora ; Psammocora contigua
|
Sequence |
CTTTACTGGTGGGCGTTAAGGCGTCACGGCCCTTTTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAGGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACATTCGCGGAGGCTAAAAATGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGATGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGTGGAGGCGAACACATTTCAACTCTT |
Structure |
(......)....(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).)..).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...))))) |
Method |
3: Partial structure |
Energy |
-12.1 kcal/mol |
Model |
52547259 |
Alignment |
Sbjct: GGATATCATCCAACGCACTTTGCGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAATGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGATGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACATTTAAACTCTTGA ..............((((.(...))))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).)..).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...))))).. Query: GGATATCATCCAACGCACTTTACTGGTGGGCGTTAAGGCGTCACGGCCCTTTTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAGGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACATTCGCGGAGGCTAAAAATGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGATGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGTGGAGGCGAACACATTTCAACTCTTGA .................(......)....(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).)..).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...))))).. CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: __________________________________(_________________________________)________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 20 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 512
End: 716 |