GI |
104304697  |
Accession |
DQ481969 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulinaceae
|
Sequence |
TCAAGCTAGGTGCTTTTTTGCTTGACAAAAATGCGGTTAGCTTGGTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGAACGGCTGGTCTTAAAGACATTAGCTTGACCCTTCACGTGGTATTGGCTCTACTCAGCGTGATAATAATCTAACCGCTGAGGACATCTTTTGGGGTGGCCAATTCTTGTTGGGGTTGCTTTCTAATCTGGTTTGCAAGAT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-13.9 kcal/mol |
Model |
104304698 |
Alignment |
Sbjct: GTGAAGTTCTCAAGCTAGGTGCTTTTTTGCTTGACAAAAATGCGGTTAGCTTGGTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGAACGGCTGGTCTTAAAGACATTAGCTTGACCCTTCACGTGGTATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTAACCGCTGAGGACATCTTTTGGGGTGGCCAATTCTTGTTGGGGTTGCTTTCTAATCTGGTTTGCAAGATTCTTGAATCCTGCTCCATTTTTCAATTTTGA .........((((((((((((.((.(.((.....))))).)))..)))))))))....((((...((((..(.((......)).))))).).)))..........(((..(((((..((((.((.(((((((((((((((((((((....))).).).))))))....).....))...)))))))))).)).)))))))))..........(.((....)))............................... Query: GTGAAGTTCTCAAGCTAGGTGCTTTTTTGCTTGACAAAAATGCGGTTAGCTTGGTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGAACGGCTGGTCTTAAAGACATTAGCTTGACCCTTCACGTGGTATTGGCTCTACTCAGCGTGATAATAATCTAACCGCTGAGGACATCTTTTGGGGTGGCCAATTCTTGTTGGGGTTGCTTTCTAATCTGGTTTGCAAGATCTTGGAATCCTGCTCCA-TTTTCAATTTGA- .........((((((((((((.((.(.((.....))))).)))..)))))))))....((((...((((..(.((......)).))))).).)))..........(((..(((((..((((.((.(((((((((((((((((((((....))).).).))))))....).....))...)))))))))).)).)))))))))..........(.((....))).................-............- CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________(_________________________________________________)_________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 411
End: 662 |