| GI |
104304695  |
| Accession |
DQ481967 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulinaceae
|
| Sequence |
TCAAGCTAGGTGCTTTTTTGCTTGACAAAAATGCGGTTAGCTTGGTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGAACGGCTGGTCTTAAAGACATTAGCTTGACCCTTCACGTGGTATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTAACCGCTGAGGACATCTTTTGGGGTGGCCAATTCTTGTTGGGGTTGCTTTCTAATCTGGTTTGCAAGAT |
| Structure |
(((((((((......((((.........))).)...)))))))))....(((((....(..(........).......)..)))))..........(((..(.(((....((.((...(((((((((((((((((((....))).)..)))))))........)...)).)))))..)).)...))))).))).....((((........)))) |
| Method |
3: Partial structure |
| Energy |
-4.9 kcal/mol |
| Model |
239923324 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATTATCAGAGCAAATATTTTGTTAATT----CAACTGCCTTTGCTTTGGACTTGGGGGCCTGCAGATTTCACAGT-----CTGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATTCTC--GGTGAACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTATC-ACTCGCTGAGGACACCCGTTGAAAAAGGTGGCCAGGCTTGCGGACGAACCGCTTCCAACGGTCTATTGACTTAGACAACGAATTTACGATCTGA------------
.........((((((((((.....((((....----.))).)..))))))))))....(((((...((((((.(...)))-----)))).)))))..........(((.((.(((..--(((((.(((((((((((((((((((((....)))-)..)))))))........).......)).))))))).))))...))))))))).......(((((......)))))..................------------
Query: GTGAAGTTTTCAAGCTAGGTGCTTTTTTGCTTGACAAAAATGCGGTTAGCTTGGTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGAACGGCTGGTCTTAAAGACATTAGCTTGACCCTTCACGTGGTATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTAACCGCTGAGGACATCTTTTG----GGGTGGCCA-ATTCTTGTTGGGGTTGCTTTCTA--ATCTGGTTTGCAAGATCTTGAATCC-TGCTCCATTTTCAATTTTGA
.........(((((((((......((((.........))).)...)))))))))....(((((....(..(........).......)..)))))..........(((..(.(((....((.((...(((((((((((((((((((....))).)..)))))))........)..----.)).)))))-..)).)...))))).))).....--((((........)))).........-....................
CBCs: _____________(((_________(_____________)_______)))___________((___________________________))____________________((_____(______________________________________________________________________________)_))____________(______________)______________________________
HCBCs: ____________(____(___________________________)____)___________________(________)______________________________(_________(_((_________(____(_____________________)___________________)__________))_)_______)_________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 92.857
II: 58.333
III: 88.235
IV: 80
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 411
End: 662
|
