GI |
193735035  |
Accession |
EU569246 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina sp. MHM342
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Sequence |
TCAAGCTTGGATGGACTTTTCCGTCCTTAGTTTGGTCGTTGGGCTCTGCCGTGACCGTGACAGGTAACGGCTGGTCTTAAAAGCATTAGCTGGCCCGTGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGTTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCGGTCTGCATATCTGGGTTGCTTCTAATCTGTATTTGATTTTTCA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-15.93 kcal/mol |
Model |
156634987 |
Alignment |
Sbjct: ACGAAATTTCTCAAGCTAGGATGGCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGG-GACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTC--CTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCGCGGATTGTTCAATCTGCGTTCCACTTTTCAGCTTTGA ..........((((((((((((((.(....).))))))).))).)))).....((.(...(((((.((.......))-.))))).).))...........(((.(((((((((.(..((..((.(.(.(((((((((((....))).)..))))))).).).))..))).))))......--.......))))))))..(((...((((((...)))))))).).......................... Query: GTGACATTTTTCAAGCTTGGATGGACTTT--TCCGTCCTTAG-TTTGGTCGTTGGGCTCTGCCGTGACCGTGACAGGTAACGGCTGGTCTTAAAAGCATTAGCTGGCCCGTGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGTTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCGGTCTGCATATCTGGGTTGCTTCTAATCTGTATTT----GATTTTTCAGCTTTGA------------------- ..........((((.((.((((((.....--.))))))..))-.)))).....((.(...(((((..(.......)...))))).).))...........(((.(((((.(((.(..((..((.(.(.(((((((((((....))).)..))))))).).).))..))).)))................))))))))..(((...(.(((.----))).))).).......------------------- CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(_____________)______________________________ HCBCs: ______________________(__________)____________________(________________________________)_________________((___(_____________________(___________________)___________________)__________________))______________(_________)________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 80 II: 90 III: 96.667 IV: 77.778 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 378
End: 601 |