GI |
1101873  |
Accession |
U19955 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Ceratobasidiaceae ; Thanatephorus ; Thanatephorus cucumeris
|
Sequence |
GTCAAACCTTTTGTTAACTCAATTGGTTCTGCAAACCTACCGGAGGTCTATTGCAGCTTGACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCTGTTAAAAAGGGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACTGCTTCTAACAGTCCATTGACTTGGACAAATATTAATTTTAT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-18.9 kcal/mol |
Model |
113877426 |
Alignment |
Sbjct: ---AAATCTTCAAAGTC-AATCTTTTGTTAATTCAATTGGTTGTGCTTTGGTATTGGAGGTCTTTTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACA--CTGTAAAAA----GTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACCGCTTCCAACAGTCCATTCACTTGGACA---ATAATTTTTATGATCTGA ---......((((((((-((((..(((......)))..))))).)))))))....(((((......((((..(...).)))).)))))..((((.((((((((((...(((((((((((.(((...))).)))))))))..)))))))..))))))..))--).(((((((----(((.((((.((.((((..((((((....))).....))))))).)))))).))---.)..)))))))....... Query: ATGAAATCTTCAAAGTCAAACCTTTTGTTAACTCAATTGGTTCTGCAAACCTACCGGAGGTCTATTGCAGCTTGACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCTGTTAAAAAGGGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACTGCTTCTAACAGTCCATTGACTTGGACAAATATTAATTTTATGATCTGA ..............((..((((..(((......)))..))))..)).........(((((......((((..(...).)))).)))))..((((.((((((((((...(((((((((((.(((...))).)))))))))..)))))))..))))))..))..).((.(((.....(((.((((.((.((((..((((((....))).....))))))).)))))).))....)...))).))....... CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ____________________(__________________)______________________________________________________________________________(___________)______________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 60 II: 100 III: 100 IV: 92.308 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 368
End: 616 |