GI |
537960  |
Accession |
Z37082 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma carnosum
|
Sequence |
TTNAANNTACAAGCCNNNNNNNGTATGCAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCNTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGAC |
Structure |
((.((..(.((.((........)).)).)...)).))...(((((((....)))).))).(.((..(((((((...((((((.((..(.((.(....(((((..(((((.(((...)))..).)))...))))))).)).))))))))))).))))).)).)..((((((....)))))) |
Method |
3: Partial structure |
Energy |
-10.9 kcal/mol |
Model |
281199963 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTTTTAATGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTC-TTTATTGGTCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGAGAAGCGTTTTTGGGCGAGCTTCTAGTCGTCTCTGTATAGAGACAATCTTATGACCTCTGA ........(((((((((((((((((...).))))))))))).)))))...(((((((....))))-))).((((..((((((((..((((((.((..((((((....(((((..((((((((((...)))))).)))...))))))))))))))))))))..))).))))).))))..((((((....))))))................. Query: ATGAAATCTTNAANNTACAAGC--CNNNNNNNGTATGCAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCNTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTC-TCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTT---GGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA ........((.((..(.((.((--........)).)).)...)).))...(((((((....)))).))).(.((..(((((((...((((((.((..(.((.(....(((((..(((((.-(((...)))..).)))...))))))).)).)))))))))---)).))))).)).)..((((((....))))))................. CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________((____))_____________________ HCBCs: ______________________________________________________(________)______(________________________________________________________________________________________________________)___________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 52.941 II: 100 III: 85.366 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 27
End: 231 |