GI |
162423803  |
Accession |
EU149823 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Fungiidae ; Cycloseris ; Cycloseris tenuis
|
Sequence |
GCACCAAGCGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTTGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTTAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGCCCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGAGCGACTCGTCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAAACCTTTTCAACTCTT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-18 kcal/mol |
Model |
52547259 |
Alignment |
Sbjct: ----GGATATCATCCAACGCACTTTGCGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAATGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGATGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACATTTAAACTCTTGA------ ----..............((((.(...))))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).)..).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))..------ Query: TGTCGGATATCATCCAACGCACCAAGCGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTTGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTTAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGCCCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGA-GCGACTCGTCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAAACCTTTTCAACTCTTGACCTCAG ..................((((......)))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).).-).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))........ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________________________________(_____________________________________________)_____________(________(____(_________________________________________________________)_)__)____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 80 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 386
End: 599 |