GI |
162423813  |
Accession |
EU149833 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Fungiidae ; Verrillofungia ; Verrillofungia scabra
|
Sequence |
GCACCTAGCCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTCCTGGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGCGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGAACGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAAATATGTTAACTCTT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-19.8 kcal/mol |
Model |
52547259 |
Alignment |
Sbjct: ----GGATATCATCCAACGCACTTTGCGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAATGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGATGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACATTTAAACTCTTGA------ ----..............((((.(...))))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).)..).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))..------ Query: TGTCGGATATCATCCAACGCACCTAGCCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTCCTGGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGCGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGA-ACGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAA-ATATGTTAACTCTTGACCTCAG ..................((((......)))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((..((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).).-..)))))))..).))))))...((((.((.-.....)...)))))........ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________(___)____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 80 II: 100 III: 96.97 IV: 85.714 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 388
End: 600 |