GI |
162423799  |
Accession |
EU149819 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Fungiidae ; Cycloseris ; Cycloseris costulata
|
Sequence |
GCACCTAGCCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTTGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTTAGAGAGACTTGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCATGGGAGCCACTCGTACGCCGAGTCGCGGAGGCGAAAACCTTTCAACTCTT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-11.8 kcal/mol |
Model |
52547259 |
Alignment |
Sbjct: ----GGATATCATCCAACGCACTTTGCGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAATGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGATGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACATTTAAACTCTTGA------ ----..............((((.(...))))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).)..).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))..------ Query: TGTCGGATATCATCCAACGCACCTAGCCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTTGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTTAGAGAGACTTGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCATGGGA-GCCACTCGTACGCCGAGTCGCGGAGGCGAAAACCTTTCAACTCTTGACCTCAG ..................((((......)))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...((..(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).).-)..))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))........ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________________________________(_____________________________________________)_________(___(________(____(_________________________________________________________)_)__)_____)______________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 80 II: 100 III: 96.97 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 388
End: 601 |