GI |
162423818  |
Accession |
EU149838 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Fungiidae ; Halomitra ; Halomitra pileus
|
Sequence |
GCACCTAGTCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCACCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGAGCGGCCCAGCCGCCGGGTCGCAGAGGCGAACACTCTTCAACTCTT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-17.91 kcal/mol |
Model |
52547259 |
Alignment |
Sbjct: ----GGATATCATCCAACGCACTTTGCGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGG-CACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAATGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGATGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACATTTAAACTCTTGA------ ----..............((((.(...))))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((.-.....(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).)..).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))..------ Query: TGTCGGATATCATCCAACGCACCTAGTCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCACCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGA-GCGGCCCAGCCGCCGGGTCGCAGAGGCGAACACTCTTCAACTCTTGACCTCAG ..................((((......)))).(.(((((((.(.((((((...(...)..))))))).))))))...)).....((((((.(..(.......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).).-).)))))....).))))))...((((.(((.....))...)))))........ CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________(___)_____________________________(_________________________________________________________________________________________)_____________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 80 II: 94.118 III: 93.939 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 388
End: 602 |