GI |
162423817  |
Accession |
EU149837 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Fungiidae ; Halomitra ; Halomitra clavator
|
Sequence |
CGCACCTAGTCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCCTCCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGAGCGGCCCAGCCGCCGAGTCGCAGAGGCCAACACTCTT |
Structure |
(((((......)))))...((((((.(.(((((.((.(....).)))))))).))))))..........((((((..(((((..((((.(.((((.(((((....(((((((.(.((((....))))).)))))))))))).))))).).))).)))))))))))....(((..(....)))) |
Method |
3: Partial structure |
Energy |
-56.7 kcal/mol |
Model |
52547228 |
Alignment |
Sbjct: ----GGATATCATCCATCGCACGCGTTCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGG-CCCTTCTTGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGTGAGACTCGCCGCGGCAAGGGTTTGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCT-AAAAATGCTTTTGTCCTTCGCGTGCACGGGAGCAACCCGGTCGCCGAGTCACCGAGGCGAACCATTCTTAAATCTTGA------ ----............(((((((...).))))))..((((((.(.(((((-((.(....).)))))))).))))))..........((((((..(((((..((((.(.((((.(((((....(((((((.(-((((....))))).)))))))))))).))))).).))).)))))))))))....(((..((...))))).........------ Query: TGTCGGATATCATCCAACGCACCTAGTCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCCTCCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGAGCGGCCCAGCCGCCGAGTCGCAGAGGCCAA-CACTCTTAACTCTTGACCTCAG .................(((((......)))))...((((((.(.(((((.((.(....).)))))))).))))))..........((((((..(((((..((((.(.((((.(((((....(((((((.(.((((....))))).)))))))))))).))))).).))).)))))))))))....(((..(.-...))))............... CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________________________________________________________________________________________________(______(_(________________________________________________________)_)______)___________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 71.429 II: 100 III: 100 IV: 80 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 388
End: 602 |