GI |
162423827  |
Accession |
EU149847 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Fungiidae ; Podabacia ; Podabacia sp. AG-2007-B
|
Sequence |
GCACCTAGTCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGCGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGAGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACAATTTTCAACTCTT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-20.3 kcal/mol |
Model |
52547259 |
Alignment |
Sbjct: ----GGATATCATCCAACGCACTTTGCGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAATGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGATGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACATTTAAACTCTTGA------ ----..............((((.(...))))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).)..).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))..------ Query: TGTCGGATATCATCCAACGCACCTAGTCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGCGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGA-GCGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACAATTTTCAACTCTTGACCTCAG ..................((((......)))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).).-).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))........ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 80 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 388
End: 601 |