GI |
162423820  |
Accession |
EU149840 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Fungiidae ; Herpolitha ; Herpolitha limax
|
Sequence |
GCACTTACTAGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTGTGGTGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGTGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGTAGCGACCCGTCCGCCGAGTCGTGGAGGCGAACACTTTTCAACTCTT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-14.8 kcal/mol |
Model |
52547259 |
Alignment |
Sbjct: ----GGATATCATCCAACGCACTTTGCGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAATGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGATGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACATTTAAACTCTTGA------ ----..............((((.(...))))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).)..).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))..------ Query: TGTCGGATATCATCCAACGCACTTACTAGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTGTGGTGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGTGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGTA-GCGACCCGTCCGCCGAGTCGTGGAGGCGAACACTTTTCAACTCTTGACCTCAG ..................((((.(...))))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(.(((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..)...-).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))........ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________(___)_________________________________________________________________(_____________(_________________________________________________________)____)____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 96.97 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 386
End: 599 |