GI |
162423796  |
Accession |
EU149816 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Fungiidae ; Ctenactis ; Ctenactis echinata
|
Sequence |
GCACTTTACTCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTGGTGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGCGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGCAGCGACCCGTCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACTTTCAACTCTT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-18.2 kcal/mol |
Model |
52547259 |
Alignment |
Sbjct: ----GGATATCATCCAACGCACTTTGCG-GTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAATGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGATGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACATTTAAACTCTTGA------ ----..............((((.(...)-)))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).)..).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))..------ Query: TGTCGGATATCATCCAACGCACTTTACTCGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTGGTGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGCGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGCA-GCGACCCGTCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACAC-TTTCAACTCTTGACCTCAG ..................((((.......)))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(.(((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..)...-).)))))))..).))))))...((((.(((...-.))...)))))........ CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________________________________________(_____________(_________________________________________________________)____)____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 80 II: 100 III: 96.97 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 393
End: 606 |