GI |
215433618  |
Accession |
EU862202 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina rugosa
|
Sequence |
GAAATTTCTCAAGCTTGGYTGACAATTTTTTTTGTCTGTCCTTAGTTKGGTTGTTGGGCTTTGCCGTCTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTCAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGGAACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCCCATTTGGGTTGCTTCTAAACCCGGTTTTGCAGATTGTTTTGATCTGTATTTCC |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-9 kcal/mol |
Model |
224459493 |
Alignment |
Sbjct: ----GCGAAATTCTTCAAGCCTTG--GATGGATTTTTTTGTCTGTCCTTGGGCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCCGATCCTCGTGTGGTACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGTTGAGGACATCTTCTGGGATGGCCAGTCATCATTTGGGTTGCTTCTAAA-CCGGTTTCGCAGATTG-CTCAATCTGTG-TGCCACTTTTCAGCTTTGA ----.((((..((((((((.((((--((((((...(...))))))).).)))))))).....))).))))..(((((...(((.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.(((((....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).)))).))))))))))).)))......-..((..(((((((.(.-....)))))))-.)))............... Query: TGTCGKGAAATTTCTCAAGCTTGGYTGACAATTTTTTTTGTCTGTCCTT-AGTTKGGTTGTTGGGCTTTGCCGTCTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTCAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGGAACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCCCATTTGGGTTGCTTCTAAACCCGGTTTTGCAGATTGTTTTGATCTGTATTTCCAATTTTCAGCTT--- ......(((..(((((.((.((.(..((((.....(...)..)))).).-)))).)).....))).)))...((.((...(((.(((.((((((((.......))..)))))).)))..))).)).)).(((...((((((.(((......(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))...))))))))).))).........((...((((((.(......)))))))...))............--- CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(___________________)____________________ HCBCs: ____________((____(_((______((____________))______)))_________))_________________________(_____________________)________________________________________________(___(________)___)________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 78.261 II: 90 III: 92.593 IV: 90 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 385
End: 639 |