GI |
313761468  |
Accession |
HQ444972 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
Sequence |
GTGAAATCCTCAAGCTTGGATGGTTTTCCGTCTTAAGCTTGGTATTGGGCTTTGCTGTGCCTTTTGTTGGAACAGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCATGTGTGTGGCGTTGGTTCCGCTCAGCGTGATAATGATCTTGACCGCTGGGGACATCTTTCGGGATGGCCAATTCTCATCTGGGTTGCTTCTAATTTGGCTTTGACAGATTCTGAATCTGTTTTGCC |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-36.7 kcal/mol |
Model |
215433632 |
Alignment |
Sbjct: ----GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTC----GTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTC-TGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGTGTTCCACATTCAGCTTGACCTCGA ----(((((..((((((((.(((((((((..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..----))).))))).(((...((((((.((((....((.(-((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..))).................. Query: TGTCGTGAAA-TCCTCAAGCTTGGATGGTTT-----TCCGT--CTTAAGCTTGG-TATTGGGCTTTGCTGTGCCTTTTGTTGGAACAGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCATGTGTGTGGCGTTGGTTCCGCTCAGCGTGATAATGATCTTGACCGCTGGGGACATCTTTCGGGATGGCCAATTCTCATCTGGGTTGCTTCTAATTTGGCTTTGACAGATTCTG-AATCTGTTTTGCCCCTTCTGTTTTG------ ....(((((.-((((((((.((((((((...-----.))))--).))).)))))-....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))......))).))))).(((...((((((.((((....((...((.(((((.((((....)))).)).))).)).)).)))))))))).)))........(((...((((((.(...-.)))))))..)))............------ CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(____________(__________)___________)________________________(_(___(__________________)__)_)__________________ HCBCs: _____(______(_______(__________________________)____________)_____)__((_(____((_______(___(_____________)___)____________))__)_))_______(____(_________(_______(_______________________)_____)_____)____)_____________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 91.304 II: 100 III: 96.296 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 377
End: 623 |