GI |
307748652  |
Accession |
AF461575 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
Sequence |
GTGAAATTCTCAAGCTAGATGCTTTTTTGTAAATAAAAAGGTTGTCTTAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCGTTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGACCCTTGTGATGACATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAGTTCTCGTNTGGGTTGCTCTCTAATCTGGCTTATGGGTTNCTCNTCGCNATTTATTCCA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-3.86 kcal/mol |
Model |
225007805 |
Alignment |
Sbjct: ----GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTCTGT------------CCTTAGTTTGGTTGTTGAGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGAACGGCTGGCCCTAAAAGCATTAGCTGATCCATGTG-TGGGACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGTTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCGGTTTTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGG-TTATGCAGATTGTTTGAATCTGTATTCCGCTTTTCAGCTTTGA------ ----(((((..((((((((.(((((((((....)))))------------.).)))))))).....))).))))).((.((...((((((.(((((((((..(...)))..)))))).)))).)))-.)).)).(((...((((((.((((..(.((.(((.(((((.((((....)))).)).))).)))))))))))))))).)))........(((-..(((((((.(.(...))))))))).)))..............------ Query: TGTCGTGAAA-TTCTCAAGC-TAGATGCTTTTTTGTAAATAAAAAGGTTGTCTTAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCGTTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGACCCTTGTGATGACATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAGTTCTCGTNTGGGTTGCTCTCTAATCTGGCTTATGGGTTNCTCNTCGCNATTTATTCCATNTTCCA-TTTTNACCTCGA ....(((((.-((((((((.-(((.(((......)))..............).)).))))).....))).))))).((.((...(((.((..((((((((..(...)))..))))))..))..)))..)).)).(((...(((((..((((....((.(((.(((((..(((....)))..)).))).))))).)))).))))).)))........(((...((((((....(...)..)))))).))).......-............ CBCs: ___________________________(______)______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(_(____(___)__)_)___________________________ HCBCs: ____________(_____(___(__(__________)________________)__)__________)________(__(_____(______________________________________)____)__)_______________(_______(__(__(__(________________)___)__)_)____)___________________(_________(_____________)_______)____________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 86.364 II: 90 III: 89.286 IV: 83.333 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 217
End: 482 |