GI |
52353918  |
Accession |
AY730686 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured ectomycorrhizal fungus
|
Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTGTCTGTCCTTGGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCCAACTTGGTTTCGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-26.9 kcal/mol |
Model |
215433632 |
Alignment |
Sbjct: ----------GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGTGTTCCAC-ATTCAGC-TTGACCTCGA---- ----------(((((..((((((((.(((((((((..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..))).-.......-..........---- Query: TTCGAGTGTCGTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGG---CTTTGTCTGT-CCTTGGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCC-AACTTGGTTTCGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGACCTCGAATCA ..........(((((..((((((((.((((((((---(...).))))-.).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))...-....(((...((((((.(.....)))))))..)))........................ CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ___________(_______________(____(____(___)__)_______)___________________)_______________________(_____________)___________________________________________(__________________________________)_______________________________(________________)______________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.652 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 359
End: 622 |