| GI |
226525001  |
| Accession |
FJ897733 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fabales ; Fabaceae ; Papilionoideae ; Genisteae ; Echinospartum ; Echinospartum barnadesii
|
| Sequence |
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGTGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGATGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGCGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTGTGACCCATGGTGGTTTGTTGGCTGCCTAAGACGGGAACCTCA |
| Structure |
((.((((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))).)).)).....(((.(((.(...)))).)))..(((((.(....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((...(((((....)))))..)))).))))))).))..)))))))).))...).)))))).)))))..(((.(.((((((((...)).)..)))))..).))) |
| Method |
3: Partial structure |
| Energy |
-56.1 kcal/mol |
| Model |
4321160 |
| Alignment |
Sbjct: GCACATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAATCGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGAGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGAACCTCAGG
((.((.((((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))).)).))))...(((.(((.(...)))).)))..(((((((....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))))))))))..(((((.((((((((...)).)..)))))..)))))..
Query: --ACATCGTTGCCCCTGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGTGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGATGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGCGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTGTGACCCATGGTGGTTTGTTGGCTGCCTAAGACGGGAACCTCA--
--.((.((((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))).)).)).....(((.(((.(...)))).)))..(((((.(....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((...(((((....)))))..)))).))))))).))..)))))))).))...).)))))).)))))..(((.(.((((((((...)).)..)))))..).)))--
CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _______________(___________________________)______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(__________________)__________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 91.304
II: 100
III: 95.238
IV: 92.308
|
| Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 397
End: 624
|
