GI |
20404  |
Accession |
X68139 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fagales ; Betulaceae ; Ostrya ; Ostrya virginiana
|
Sequence |
TTGCCCCCAACCCCTCCGCCTCTTCGAGAGACGAGGGCAGTTTGCGGGGCGGACATTGGCCTCCCGTGAGCTTCCACTCGCGGCTGGCCTAAAAGCGAGTCCTAGGCGACGAGCGCCACGACAATCGGTGGTTGTAAAACCCTCGTGTCCCGTCGTTCGCGCCTCGTCGCTCATCTTGTGCTCTGTGACCCTGTAGCGTCGCGATCGCGACTCTTCCAATCG |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-62.2 kcal/mol |
Model |
57335172 |
Alignment |
Sbjct: ACGCATCGTTGCCCCCAACCCCCATCGCCTCTCTAAGAGGCGAGGGCAGTTTGCGGGGCGGACATTGGCCTCCCGTGAGCTTCCACTTGCGGTTGGCCTAAAAGCGAGTCCTAGGCGACGAGCGCCACGACAATCGGTGGTTGCCAAAACCCTCGTGTCCCGTCGTGCGTGCCTCGTTGCTCATCTTGTGCTCTATGACCCTGTAGTGTCGCGATTGCGACTCTTCCAATGCGA ........((((((((((.((((.((((((((...)))))))))))..).))).))))))).....((((..(((((((.(...))))))))..)))).....(((((....(((((((((((((((((((.(((((.((((.....)))).))).))...)))))).))).)))))))))..))))))....(.((....(.(((.(((((....))))).))...)))).). Query: ACCAATCGTTGCCCCCAACCCCT-CCGCCTCTTCGAGAGACGAGGGCAGTTTGCGGGGCGGACATTGGCCTCCCGTGAGCTTCCACTCGCGGCTGGCCTAAAAGCGAGTCCTAGGCGACGAGCGCCACGACAATCGGTGGTTG-TAAAACCCTCGTGTCCCGTCGTTCGCGCCTCGTCGCTCATCTTGTGCTCTGTGACCCTGTAGCGTCGCGATCGCGACTCTTCCAAT-CGA ........((((((((((.((((-.((.((((...)))).)).)))..).))).))))))).....((((..(((((((.(...))))))))..)))).....(((((....(((((((((((((.(((((.(((((.((((.-...)))).))).))...)))))..))).)))))))))..))))))....(..(....(.(((.(((((....))))).))...)))-.). CBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________(____________________)________________________________(__________)____________________________(______(_____________________________________________)_______)________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 90.909 II: 100 III: 96.97 IV: 91.667 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 211
End: 442 |