Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
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ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

GI 169260529

Figure

(Save as SVG or PNG)

Details

GI 169260529 see NCBI Nucleotide
Accession EU347836
Date 2011/04/01
Lineage see NCBI Taxonomy root cellular organisms Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Streptophytina Embryophyta Tracheophyta Euphyllophyta Spermatophyta Magnoliophyta eudicotyledons core eudicotyledons rosids fabids Fabales Fabaceae Papilionoideae Crotalarieae Lebeckia Lebeckia halenbergensis 
Sequence TCGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTGTGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACG
Structure (((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))).((((.((.....)).))))..(((..((((..(((((.....((((((.((((.((.((((((.(((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))))))).))))))).))))).))))))))))))).......(((((..(((....))))))))
Method 3: Partial structure
Energy -74.1 kcal/mol
Model 152003664
Alignment
Sbjct: CATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGTGCCAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCATGGTTGGTTGAAAACCGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGGCCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGG--
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Query: -ACTCTCGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTGTGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA
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 CBCs: _____________________________________________________________________________(__________________________________________________________________________________________________________)____________________________________
HCBCs: ______(_____________(_________)________________)____________________________________________(________________________________(___________________)______________________________)____________________________________________
Transferred percentage of helices I: 100
II: 100
III: 100
IV: 100
Annotation Process: Blast (re)annotation
Start: 399
End: 619

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