GI |
27497403  |
Accession |
AJ534709 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina sp. A32
|
Sequence |
TCAAGCTAGGATGGCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTNCCTTTGGG |
Structure |
((((((..(((((((.....))).))))...)).)))).....((.(...((..((((((.....)))))))).).))............((((....((((.((..(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))....)))..))).)))).((.(....))) |
Method |
3: Partial structure |
Energy |
-13 kcal/mol |
Model |
148612679 |
Alignment |
Sbjct: --------GTGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTGTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGCCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCT-CATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA --------..........(((((((..(((((((.....))).))))..))).)))).....((.(...((..((((((.....)))))))).).))...........(((((....((((.((..(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))....)))..))).)))))((-(....))).......................................................... Query: CGAGTGTCACGAAATTTCTCAAGC-TAGGATGGCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTNCCTTTGGG---------------------------------------------------------- ..................((((((-..(((((((.....))).))))...)).)))).....((.(...((..((((((.....)))))))).).))............((((....((((.((..(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))....)))..))).)))).((.(....)))---------------------------------------------------------- CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________(_____________________________________________________________)____________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 92.857 II: 100 III: 96.296 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 386
End: 584 |