GI |
299480141  |
Accession |
HM146803 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGCTTTGTTGTCTGTCCTCAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGNGTCCTTCATNTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGNTTNTAAANCCTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTCCA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-13 kcal/mol |
Model |
215433639 |
Alignment |
Sbjct: --------GCGAAATTTCTCAAGC-TTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCAT-TGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGYTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAA-CTTGGTTTCACAGATTGTACAATCTGTGTTCCACATTTCAGCTTTGA --------(((((..((((((((.-(((((((((..(...)))))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((-.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))......-..(((...((((((.(.....)))))))..))).............. Query: CGAGTGTCGCGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGCTTTGTTGTCTGTCCTCAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGNGTCCTTCATNTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGNTTNTAAANCCTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTG-TCCACTTTTCAGCT---- ........(((((..((((((((..((((((((...(...).)))).).))).))))).....))).))))).(.(((...(((..((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))).).(.(...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).).).........(((...((((((.(.....)))))))-.)))..........---- CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ___________________________(___(___________)_____)_____________________________________________(_____________)___________________________________________(________(________________)________)_______________________________((________________))___________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.652 II: 95 III: 96.296 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 385
End: 639 |