GI |
87244877  |
Accession |
DQ377375 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulinaceae
|
Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGRCATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTGTTCAATCTGTGGCTCCA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-15.4 kcal/mol |
Model |
157057268 |
Alignment |
Sbjct: --------GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGCCCTTCATTGGGGACGGCTGGCCTTATAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGT-GTTCCACTTTTCAGCTTTGA --------(((((..((((((((.((((((((...(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.(((.(((((((((..(....)))..)))))).)))).))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....))))))-)..))).............. Query: CGAGTGTCGTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTATT-GGGACGGCTGGCCTTA-AAAGCATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGRCATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTGTTCAATCTGTGGCTCCACTTTTCAG------ ........(((((..((((((((.((((((((...(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.-((.(((((((((..(.-..)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.(((......))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))).)..)))........------ CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________(___________)________________________________(____(__________________________________________)__)____________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 95.238 III: 96.154 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 355
End: 606 |