GI |
18451  |
Accession |
X15589 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Rosales ; Rosaceae ; Rosoideae ; Rosodae ; Potentilleae ; Fragaria ; Fragaria x ananassa
|
Sequence |
CGTCGTTGCCCCCCTGACCCCTTCGGGGTCGGACGGGACGGATGATGGCCTTCCCGTGTGCCCCGTCACGCGGTTGGCATAAATACCGAGTCCTCGGCGACCGGCGGTCCGGCGATCGGTGGTTGTCAAACCTCGGTGCCTTGTCGCGTGCGTGAGTCGATCGCGGGACTTCCTTAGCCGTAAGCGCGTCGGTAACCCGACGTTT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-74.2 kcal/mol |
Model |
93099961 |
Alignment |
Sbjct: ----ACACGTCGTTGCCCCCCCCGACCCCTTCGGGGGTCGGACGGGACGGATGATGGCCTTCCCGTGTGCCCCGTCACGCGGTTGGCATAAATACCGAGTCCTCGGCGACCGGCGRCGCGGCGATCGGTGGTTGTCAAACCTCGGTGCCRTGTCGCGTGCGTGAGTCGATCGCGGGACTTCCTTAACCGTAAGCGCGTCGGTAACCCGACGCTTT-- ----...(((((((.((((..((((((((....))))))))..)))..))))))))(((...((((((((...).)))))))..))).........(((((((((((((((.((((((((((((((((.((((....)))))))))....)))))))).)))).)))).))).)))))))..........((((..(((((....))))))))).-- Query: CGTCACACGTCGTTG-CCCCCCTGACCCCTTC-GGGGTCGGACGGGACGGATGATGGCCTTCCCGTGTGCCCCGTCACGCGGTTGGCATAAATACCGAGTCCTCGGCGACCGGCGGTCCGGCGATCGGTGGTTGTCAAACCTCGGTGCCTTGTCGCGTGCGTGAGTCGATCGCGGGACTTCCTTAGCCGTAAGCGCGTCGGTAACCCGACGTTTCAA .......(((((((.-(((..((((((((...-))))))))..)))...)))))))(((...((((((((...).)))))))..))).........(((((((((((((((.(((((.((((((((((.((((....)))))))))....))))).)).)))).)))).))).)))))))..........((((..(((((....)))))))))... CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________(________________)___________________________________________________________________________((_______________________________________))__________________________________(__________________)_____ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.737 II: 100 III: 97.143 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 405
End: 620 |