| GI |
18866  |
| Accession |
Z11759 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; Liliopsida ; commelinids ; Poales ; Poaceae ; BEP clade ; Pooideae ; Triticeae ; Hordeum ; Hordeum vulgare
|
| Sequence |
CGCTCCCAACCACCCTCTTCGGGAATTGGGATGCGGCATATGGTCCCTCGTCCTGCAAGGGGCGGTGGGCCGAAGATCGGGCTGCCGGCGTACCGCGTCGGACACAGCGCATGGTGGGCGTCCTTGCTTTATCAATGCAGTGCATCCGACGCGTAGACGGCATCATGGCCTCGAAACGACCCATCGAACGAAGTGCACGTCGCTTCGAC |
| Structure |
(((((((((...(((.....)))..)))))).))).....((((((.(((((((....))))))).))))))....(((((((((((.(.((.((((((((((((.(((..(((((((((....))).)))))).))).)))..)))))))))))).)))).....)))).)))...........(..(((((((.....))))))).) |
| Method |
3: Partial structure |
| Energy |
-85.6 kcal/mol |
| Model |
222139383 |
| Alignment |
Sbjct: ----ACGCCAAAACACGCTCCCAACCACCCTCTTCGGGAATTGGGATGCGGCATATGGTCCCTCGTCCTGCAAGGGGCGGTGGGCCGAAGATCGGGCTGCCGGCGTACCGCGTCGGACACAGCGCATGGTGGGCGTCCTTGCTTTATCAATGCAGTGCATCCGACGCGTAGACGGCATCATGGCCTCGAAACGACCCATCGAACGAAGTGCACGTCGCTTCGACCGCGA
----...........(((((((((...(((.....)))..)))))).))).....((((((.(((((((....))))))).))))))....(((((((((((.(.((.((((((((((((.(((..(((((((((....))).)))))).))).)))..)))))))))))).)))).....)))).)))..........((..(((((((.....))))))).).)...
Query: CGTCACGCCAAAACACGCTCCCAACCACCCTCTTCGGGAATTGGGATGCGGCATATGGTCCCTCGTCCTGCAAGGGGCGGTGGGCCGAAGATCGGGCTGCCGGCGTACCGCGTCGGACACAGCGCATGGTGGGCGTCCTTGCTTTATCAATGCAGTGCATCCGACGCGTAGACGGCATCATGGCCTCGAAACGACCCATCGAACGAAGTGCACGTCGCTTCGACC----
...............(((((((((...(((.....)))..)))))).))).....((((((.(((((((....))))))).))))))....(((((((((((.(.((.((((((((((((.(((..(((((((((....))).)))))).))).)))..)))))))))))).)))).....)))).)))...........(..(((((((.....))))))).).----
CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 100
III: 100
IV: 88.889
|
| Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 373
End: 598
|
