GI |
21222  |
Accession |
Z11760 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; Liliopsida ; commelinids ; Poales ; Poaceae ; BEP clade ; Pooideae ; Triticeae ; Secale ; Secale montanum
|
Sequence |
CGCTCCCACACCCCTCATTGGGAATCGGGATGCGGCATCTGGTCCCTCGTCTCGCAAGGGGCGGTGGACCGAAGTTCGGGCTGCCGGCGTACCGTGTCAAACACAGCGCGTGGTGGGCGTCTTTGCTTTATCAACGCAGTGCATACGACGCGTAGCCGGCATGATGGCCTCAAAACGACCCAACAAACGTAGCGCACGTCGCTTCGA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-63.4 kcal/mol |
Model |
13398310 |
Alignment |
Sbjct: ----ACGCCAAAACACGCTCCCACACCCCTCATTGGGAATCGGGATGCGGCATCTGGTCCCTCGTCTCGCAAGGGGCGGTGGACCGAAGTTCGGGCTGCCGGCGTACCGTGTCAAACACAGCGCGTGGTGGGCGTCTTTGCTTTATCAACGCAGTGCATACGACGCGTAGCCGGCATGATGGCCTCAAAACGACCCAACAAACGTAGCGCACGTCGCTTCGACCGCGA ----...........(((((((..(.(((.....)))..).)))).))).....((((((.(((((((....))))))).))))))....(((...(((((((.((.((((((..((((.(((..(((((((((....))).)))))).))).)))..)..))))))))))))))))))..((.((.((.((((.(..(.(...).).)...)))).)).))..)).. Query: CGTCACGCCAAAACACGCTCCCACACCCCTCATTGGGAATCGGGATGCGGCATCTGGTCCCTCGTCTCGCAAGGGGCGGTGGACCGAAGTTCGGGCTGCCGGCGTACCGTGTCAAACACAGCGCGTGGTGGGCGTCTTTGCTTTATCAACGCAGTGCATACGACGCGTAGCCGGCATGATGGCCTCAAAACGACCCAACAAACGTAGCGCACGTCGCTTCGACC---- ...............(((((((..(.(((.....)))..).)))).))).....((((((.(((((((....))))))).))))))....(((...(((((((.((.((((((..((((.(((..(((((((((....))).)))))).))).)))..)..)))))))))))))))))).....((.((.((((.(..(.(...).).)...)))).)).))..---- CBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 84.615 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 377
End: 601 |