| GI |
17923  |
| Accession |
X68136 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fagales ; Betulaceae ; Betula ; Betula pendula
|
| Sequence |
TTGCCCCCAACCCCATCTCCTTGCAAAGGGACGAGGGGGCCTGTGGGGCAGAAATTGGCCTCCCGTGAGCTCATGCATGCGGTTGGCCTAAAAGCGAGTCCTCGGCGACGCGCGCCACGACAATCGGTGGTTGTCAAACCCTCGTGTCCCGTCGTGCGTGCGTGCGCGTCGCTCATCGTGTGCTCCTTGACCCTGCTTGTGTCGCGCTAGCGAAGC |
| Structure |
(((((((..(((((.(((.(((....)).)).)))))).....)))))))).....((((..(((((.((....)).)))))..))))...(((.(((.(.((((((((((((((((((((.(((((.((((....)))).))).))...)))))).))))....))))))))....).).)))))))..........((.((((....)))).)) |
| Method |
3: Partial structure |
| Energy |
-68.5 kcal/mol |
| Model |
199600006 |
| Alignment |
Sbjct: ----ACGCATCGTTGCCCCCAACCCCATCTCCTTGCAAAGGGACGAGGGGGCCAATGGGGCAGAAATTGGCCTCCCGTGAGCTCATGCATGCGGTTGGCCTAAAAGCGAGTCCTCGGCGACGCGCGCCACGACAATCGGTGGTTGACAAACCCTCGTGTCCCGTCGTGCGTGC---CGCGTTGCTCATCGTGTGCTCTTTGACCCTGC-TGTGTCGCGCTAGCGACGCTTCCA------
----........(((((((..(((((.(((.(((....)).)).)))))).....)))))))).....((((..(((((.((....)).)))))..))))...(((.(((.(.((((((((((((((((((((.(((((.((((....)))).))).))...)))))).))))---.))))))))....).).)))))))........-.(((((((....))))))).....------
Query: CTAGACCCATCGTTGCCCCCAACCCCATCTCCTTGCAAAGGGACGAGGGGGCCTGTGGGGCAGAAATTGGCCTCCCGTGAGCTCATGCATGCGGTTGGCCTAAAAGCGAGTCCTCGGCGACGCGCGCCACGACAATCGGTGGTTGTCAAACCCTCGTGTCCCGTCGTGCGTGCGTGCGCGTCGCTCATCGTGTGCTCCTTGACCCTGCTTGTGTCGCGCTAGCGAAGCTTCCAACGCGA
............(((((((..(((((.(((.(((....)).)).)))))).....)))))))).....((((..(((((.((....)).)))))..))))...(((.(((.(.((((((((((((((((((((.(((((.((((....)))).))).))...)))))).))))....))))))))....).).)))))))..........((.((((....)))).))...........
CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _________________________________________________________________________________________________________(____________(______________________________________________________________)_______________)_________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 100
III: 100
IV: 85.714
|
| Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 206
End: 445
|
