GI |
169620  |
Accession |
L08736 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Pucciniomycotina ; Pucciniomycetes ; Pucciniales ; Pucciniaceae ; Puccinia ; Puccinia recondita
|
Sequence |
ACCCTCTCATTAAACATTTTTTAACTTGTTTAAACTTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTCATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTGTTTAATATAAGGGACTTCTAAAAACCCCCCTTTTTTCCAAAA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-9.11 kcal/mol |
Model |
110006726 |
Alignment |
Sbjct: ----GGCACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTAAACATTTTTTAACTTGTTTAAACTTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTCATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTGTTTAATATAAGGGACTTCTAAAAACCCCCCTTTTTT-CAAAATTTAAGA------ ----.........................(.(.((.(((((((((...(((((....)).)))..))))))))))).).)(((((..((((....)))).)))))....(.((.(((((.(((((.(((((((.(((.......((((((..(.(((((..(.(.......).)))))).)..))))).)))).))))))))....))))))))).))).........((((..-.)))).......------ Query: AAAAGGCACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTAAACATTTTTTAACTTGTTTAAACTTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTCATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTGTTTAATATAAGGGACTTCTAAAAACCCCCCTTTTTTCCAAAATTTAAGACCTCAA .............................(.(.((.(((((((((...(((((....)).)))..))))))))))).).)(((((..((((....)))).)))))....(.((.(((((.(((((.(((((((.(((.......((((((..(.(((((..(.(.......).)))))).)..))))).)))).))))))))....))))))))).))).........((((....))))............. CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 172
End: 424 |