GI |
685039  |
Accession |
S72866 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Acoelomata ; Platyhelminthes ; Trematoda ; Digenea ; Strigeidida ; Schistosomatoidea ; Schistosomatidae ; Schistosoma ; Schistosoma japonicum
|
Sequence |
TCACGACGCACATTAAGTCGTGGATTGGCCGAGTGCCTGCCGGCATGTTTGATGCGCTCGTATATATGAATGCGGGTTGCTGCTGGTCAAAGGCTCCGTCCGAATAATCCGACCACAGCCTAGTCCGGTCTAGATAGCCAGATTAAGATGCTGCAGTGGGTTGTGCTCGAGTCATGGCTTAATGATAATTTCCTTTATACATGCTCGAGAAGAACACACCTACCGTAAGCTAAGTTAATCACTTAATCATGGCTCTATGATTTGGTCTATGGTTTGTATCGAGGGTGTGTGCTTTGTACACA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-61.33 kcal/mol |
Model |
33772001 |
Alignment |
Sbjct: GGCTTTTCATATATCACGACGCACATTAAGTCGTGGATTGGGCGAGTGCCTGCCGGCAT-----ATATACCCGTATATC--AACGCGGGT---TGCTGGTCAAAGGCTCCGTCCTAATAATCCGGCCACAGCCTAGTCCGGTCTAGATGACCAGATTGAGATGCTGCGGTGGGTTGTGCTCGAGTCGTGGCTTAATGATA-------TTGTACATGCTCGGGAATAAACACGCCTATCGTATGCTATGTTAATCACTTGATCTTGGCTCTATGATTTGGTCTATGGTTTGTACCGAAGGTGTGTGTATATCATGCACAAAATGATTAATATAATTGACCCTGA .............(((((((..(...)..))))))).(.(((((.(.(((((((((((.-----....((((((.(...--)..))))))---)))))))...))))).))))).)......(((..(((((((((.((((((((((.(.((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((..(((((...)-------))).)))))))))))..)..))).)))))))))).)).))........))))))).)))))))).)).)))).))).)).)))).)))....(((((..((...)))))))......................... Query: GGCTTTTCATCTATCACGACGCACATTAAGTCGTGGATTGGCCGAGTGCCTGCCGGCATGTTTGATGCGCTCGTATATATGAATGCGGGTTGCTGCTGGTCAAAGGCTCCGTCCGAATAATCCGACCACAGCCTAGTCCGGTCTAGATAGCCAGATTAAGATGCTGCAGTGGGTTGTGCTCGAGTCATGGCTTAATGATAATTTCCTTTATACATGCTCGAGAA-GAACACACCTACCGTAAGCTAAGTTAATCACTTAATCATGGCTCTATGATTTGGTCTATGGTTTGTATCGAGGGTGTGTG--CTTTGTACACAA------------------------ .............(((((((..(...)..))))))).(.((.((.(.(((((((((((..........((((((.(.....)..))))))...)))))))...))))).)).)).)......(((..(((((((((.((((((((((...((((((((((.((((((.(((((((((.((((((.((((..(((((...).......))).)))))))))))..-..))).)))))).))).)).).........))))))).))).)))).)).)))).))).)).)))).)))....(((((.--(...).))))).------------------------ CBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________(_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________)______________(___)_______________________________ HCBCs: ____________________________________________________________________(_(________________)_)__________________________________________________________________((__________(____(_____(______(_____(________________)____)_____)__________)____)____________________))____________________________________________(_________)_____________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 96 III: 93.939 IV: 85.714 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 110
End: 425 |